后期指定，通常指商標獲得了國際注冊后，該
商標注冊人又就同一商標申請指定有關締約方給予商標保護。如，某公司于2002年5月在世界
知識產權組織國際局獲得了商標國際注冊，該注冊的申請中指定了締約方甲對申請的商標予以保護。后來由于注冊人產品出口擴大到多個國家，其中包括締約方已和丙。這樣，需要其國際
注冊商標在締約方乙和丙得到保護。故在次年的12月，注冊人就相同商標提出申請，指定締約方乙和丙予以保護。此種指定常稱為為“后期指定”。在性質上，后期指定申請等同于商標國際注冊申請，其目的也是申請人期望其商標能夠在后期指定申請中的被指定締約方獲得保護。
后期指定的申請人資格、國內的基礎注冊和基礎申請與后期指定締約方的關系等，基本上與商標國際注冊申請相同;但商品或服務的范圍及其類別可以有所不同。此處的不同是指縮小商品或服務的范圍，或減少類別。
我國商標國際注冊的注冊人申請與《馬德里協定》有關的后期指定的;應當填寫法文申請書和中文申請書，并應當通過商標局向國際局提交法交申請。申請與《馬德里議定書》有關的后期指定的，可以通過商標局向國際局提交申請，也可以由申請人直接向國際局提交申請。通過商標局向國際局提交申請的，應當填寫并提交英文或法文申請書以及中文申請書，申請人直接向國際局提交申請的，僅填寫并提交外文申請即可。無論是通過商標局向國際局提交申請，還是不通過商標局提交申請，申請人可以根據自己的意愿決定是否委托代理人代理。
后期指定的英文申請表格為“MM4(E)”、法文為“MM4F(F)”，
申請人可以從國際局網站上下載。后期指定的中文申請書式由商標局提供。
商標局收到后期指定申請后，對其進行形式審查，但不作實質審查。其審查程序基本同于領土延伸申請的審查(包括費用的審查)。審查完畢后，商標局將申請寄交國際局。
國際局收到后期指定申請之后，對其進行形式審查，并在注冊簿上登記，予以公告。此外，國際局向被后期指定的締約方主管局寄送后期指定申請書。
由于后期指定申請等同于商標國際注冊保護申請，這就決定了被后期指定的締約方主管局將依據該締約方的法律，對后期指定申請進行實質審查。審查程序基本上與對領土延伸申請的審查無異。經審查，認為符合法律規定的，準予保護。由于國際局公告后期指定的申請，所以，被后期指定締約方可以不再公告準予保護的商標，即使公告，申請人也無義務繳納公告費。其他機構無權要求申請人在被后期指定的締約方里公告其商標。如果經審查，認為后期指定申請不符合法律規定的，被后期指定締約方主管局駁回申請，并書面通知國際局。駁回的時限根據被后期指定締約方受《馬德里協定》或《馬德里議定書》約束情況而定。駁回日期始于后期指定申請書上的通知日期。國際局收到駁回通知書后，將該駁回通知書寄交申請人或其代理人。申請人對駁回不服的，可以在駁回通知書注明的法定期內，向被后期指定締約方的復審機關申請復審，或向司法機關起訴。申請復審或起訴的，一般需要委托代理人代理。
